A tatárok pusztítása után, már 1252-ben, Šalát adta IV. Bélának. az újonnan alapított törökországi premontrei kolostorba. Vagyona Šaľa és az itt kialakult kastély maradt a XVI. század. XVI. század a törökökkel folytatott háborúban sok szenvedést hozott Shale lakóinak. V XVII. században katonai erődöt építettek itt. Védelmi funkciója Nové Zámky felszabadítása után ért véget.
XVI. század a pala jogi státusában is változásokat hozott. Amikor I. Ferdinánd király 1536-ban Šaľát kiváltságos várossá léptette elő, megkapta a jogot a heti piacok és két éves vásár fenntartására.
XVI-tól. A 19. században a šali birtok bevétele a jezsuitáké volt, akik 1598-ban ide költöztették a főiskolát Kláštor pod Znievomból. Több fontos személyiség dolgozott itt, amelyek közül különösen Peter Pazmáň tűnik ki.
Érdekes a város szimbólumának a XVI. század. A polgármester által már ebben a században kiadott dokumentumokat pecsétekkel látták el. A legrégebbi ismert pecsétet már 1543-ban használták. A mező közepén, egy késő gótikus pajzson fülek vannak vésve, amelyek között függőlegesen egy makimajzatot helyeznek el. Szintén új pecsét az 1920-as évekből. században megtartja ezt a motívumot. A pecsét képét a XVIII. században, amikor a város az osztrák sas szimbólumaként szolgált, ezzel kifejezve a királyi kamarától való függőségét.
A város fejlődése számos katasztrófa, különösen a gyakori árvizek és járványok ellenére is folytatódott, még a XIX. század. A fejlődést elősegítette a Bécs és Budapest közötti vasútvonal megépítése 1850-ben is, a 19. század második felében. században Šaľa Nyitra megye közhivatalának közigazgatási központjává vált. A kultúra elterjedéséről a 19. század végén. századunk elején különféle egyesületek megérdemelték, de a David Kollman nyomda alapítását is az első világháború előtt. Az 1907-1912-es években megjelent a Šaľa a okolie ("Vágsellye és vidéke") újság, amelyet 1911 óta nyomtatnak egy helyi nyomdában. A Csehszlovák Köztársaság megalakulása után a város körzeti központ maradt. 1938. november 2-tól a város a bécsi választottbírósági értelemben Magyarországhoz tartozott, de még ebben az időszakban is megőrizte adminisztratív helyzetét, és továbbra is a főkerület központja volt. Šaľa városa 1945. március 31-én felszabadult, és a helyreállított Csehszlovákiában 1960-ig körzeti város maradt. 1996. július 24. óta Šaľa város ismét a Šaľa kerület székhelye.