Lokalita obce byla osídlena již v neolitu, bylo zde odkryté sídliště volútovej kultury i hroby z doby halštatské. První písemná zmínka o obci pochází z roku 1244, kdy král Belo IV. přidělil trnavským hostům zem Pára, což je zhruba dnešní území obce.
Lokalita obce byla osídlena již v neolitu, bylo zde odkryté sídliště volútovej kultury i hroby z doby halštatské. První písemná zmínka o obci pochází z roku 1244, kdy král Belo IV. přidělil trnavským hostům zem Pára, což je zhruba dnešní území obce.
Uvádí se jako Alba Ecclesia v letech 1332-1337, později se nazývala possessio Feyrhegyház 1387 a Weissenkirche 1934. Matej Bel první etymologizoval název obce: Bily Kostel -Slováci volají vesnici Bílý Kostel od bělosti kostela, kterou kdysi předtím zářil. V roce 1561je Alba Ecclesia deserta - Bily Kostel opuštěný. Důvodem zpustošení obce bylo táboření španělského vojska. Když zpustošenou obec v roce 1548 král Ferdinand daroval Tomášovi Tóthovi a jeho potomkům, vzpomíná se už jen jako majer s rybníkem. V roce 1635 rád jezuitů založil Trnavskou univerzitu a Bílý Kostel si vybrali jako svou odpočinkovou zónu. V té době kromě kapličky stálo v Bílém Kostele sedm domů s asi třiceti stálými obyvateli. Nově koupená nemovitost začali zvelebovat. Postavili i jezuitskou rezidenci (zámeček) a založili malou farmu. Za Vlády Marie Terezie 1740-1780 v tomto období nebyl Bílý Kostel řádnou vesnicí a zde žijící obyvatelstvo byly převážně nádeníci pracující na jezuitském majetku. V roce 1773 byl zrušen jezuitský řád a součástí byly i majetkové změny. Bílý Kostel byl v roce 1775 propuštěn Antonínovi Brunšviku oblíbenci Marie Terezie. V roce 1828 byl proveden soupis daně platícího obyvatelstva, kde bylo dohromady 37 obydlených domů av nich bývalo spolu 43 rodin. Začátkem devadesátých let patřil majer a několik hospodářské budovy Juliovi Schlesinger, který spolu s manželkou obýval i zdejší zámeček. V katastru vlastnil téměř veškerou půdu. V období 1914 - 1948 zaznamenala obec Bílý Kostel rozmach. Jedním z hlavních cílů obyvatel bylo postavit kostel, který vzhledem k její název v obci paradoxně chyběl. Kostel se podařilo dokončit v roce 1941. Po válce byl po pozemkové reformě v roce 1948 majer přidělen k státním majetkem a později ho dostalo místní JZD, které patřilo mezi první v okrese a dokonce na celém Slovensku.
K důležité změně v životě obce přišlo 1. ledna 1974, kdy byla administrativní připojena k městu Trnava až do roku 1993, kdy se obec znovu osamostatnila.