Umfangreiche Rekonstruktionen betrafen auch den Kern des Schlosses mit Wohnräumen. Der massive Bergfried wurde zusammen mit den meisten Befestigungen der Akropolis abgerissen und durch ein massives vierflügeliges Gebäude auf dem Grundriss eines unregelmäßigen Trapezes ersetzt. Es war eine ähnliche Art von befestigter königlicher Residenz, wie wir sie zum Beispiel aus Zvolen oder Vígľaš kennen und die mit italienischen Schlössern verbunden ist. In den südlichen und östlichen Flügeln des Schlosses befanden sich Wohn- und Repräsentationsräume, die beiden anderen Flügel wurden für wirtschaftliche und betriebliche Zwecke genutzt.
Das unmöblierte Gebäude wurde mehrere Jahre lang vom ungarischen König Ladislav Pohrobok als Sitz genutzt, nach dessen Tod (1454) die Bedeutung der Burg abnahm.
Die Karte wurde im Zusammenhang mit der Expansion des Osmanischen Reiches umgekehrt, dessen Truppen 1529 die damalige ungarische Hauptstadt Buda eroberten. Bratislava wurde die neue Hauptstadt des Königreichs, das bereits von den Habsburgern regiert wurde, und die Burg von Bratislava wurde in diesem Jahr in den Jahren 1552-62 einer Renaissance-Rekonstruktion unterzogen. für den König von Ungarn. Von der zweiten Hälfte des 16. Jahrhunderts bis zur Regierungszeit Josephs II. Der Kronenturm war ein Ort der Erhaltung ungarischer Krönungsjuwelen.
Die Kriegsereignisse der Türkenkriege und die Aufstände gegen die Habsburger betrafen auch die Burg Bratislava, deren schlechter Zustand nach 1629 eine umfassende Barockrestaurierung durch den kaiserlichen Architekten Carlon erforderte. Pavol Pálfi, als Erbkapitän der Burg Bratislava, überwachte ebenfalls den Bau. Die Dächer des Schlosses wurden ersetzt, der Palast wurde auf einer Etage errichtet und erhielt so die heutigen Ausmaße. Sie bauten Türme an drei Ecken und es gab auch eine Vereinheitlichung der Fassaden und Innenmodifikationen. Die Befestigungen der Burg wurden durch den Bau der sogenannten Burg verstärkt Leopolds Bastion.
Während der Regierungszeit von Maria Theresia wurde der Schlosskomplex von Bratislava umfassend rekonstruiert, um den Bedürfnissen der Residenz der ungarischen Königin gerecht zu werden. Zu dieser Zeit wurde die Burg auch Sitz des ungarischen Gouverneurs Albert von Sachsen-Tešín. Neben Änderungen am Schloss selbst, die seine Repräsentativität und seinen Komfort erhöhen sollten, wurde es auch um mehrere Nebengebäude erweitert. Von der Ostseite, vol. Theresian, wo es Wohnräume gab, wurde eine überdachte Reithalle von Norden hinzugefügt, zusammen mit einem Barockgarten und einem Gartenpavillon. Eine wirtschaftliche Erweiterung wurde der Westseite hinzugefügt.
Ein Wendepunkt in der Geschichte der Burg Bratislava war die Ankunft Josephs II. auf den königlichen Thron. Er hob das Amt des ungarischen Gouverneurs auf und verlegte die Regionalbüros von Bratislava nach Wien. Infolgedessen verlor das kürzlich fertiggestellte Schloss seine Nutzung in Form einer repräsentativen Residenz. 1784 ließ sich hier ein allgemeines Seminar nieder, in dem die Priester der katholischen Kirche ausgebildet wurden. Einer seiner Absolventen war zum Beispiel Anton Bernolák. Die Burg entsprach jedoch nicht sehr gut dem neuen Zweck.
Die Armee wurde 1802 ein neuer Benutzer der Burg Bratislava, und die ursprünglichen repräsentativen Räumlichkeiten wurden in Herbergen für Soldaten umgewandelt. Dies machte die Burg auch tödlich, da die Soldaten 1811 achtlos ein Feuer verursachten, bei dem das Palastgebäude und viele Häuser auf dem Schlossgelände niederbrannten. Der Palast wurde in eine Ruine verwandelt, aber das Schlossgelände wurde immer noch von der Armee für ihre eigenen Bedürfnisse genutzt.
Diese Situation begann sich nach dem Zweiten Weltkrieg zu ändern, als die Armee die Burg von Bratislava verließ. Die erste zivile Nutzung des Schlossgeländes war der Bau eines Amphitheaters auf der Nordterrasse des Schlosses, bei dem das Gelände erheblich beeinflusst wurde.
Das Schloss selbst wurde 1953 restauriert. Die Idee wurde vom Schriftsteller und Maler Janko Alexy und den Autoren des Projekts Alfred Piffl und Dušan Martinček initiiert. In den Jahren 1956 - 68 fanden Wiederaufbauarbeiten statt, deren Ziel es war, die Burg aus der Zeit der Theresianer wieder in ihre Form zu bringen. Die Burg, bereits als nationales Kulturdenkmal, wurde zum Ausstellungsraum des Slowakischen Nationalmuseums und es gab auch repräsentative Räume des Slowakischen Nationalrates.
Eine weitere umfassende Restaurierung der Burg selbst, diesmal verbunden mit detaillierten archäologischen und historisch-architektonischen Forschungen, wurde in den Jahren 2008 - 2014 durchgeführt. Sie wurde vom Nationalrat der Slowakischen Republik finanziert und ist Teil eines umfangreichen Projekts zum Wiederaufbau das Aussehen des Schlosses und seiner Umgebung. Wiederaufbau während der Regierungszeit von Maria Theresia. Es umfasst auch die Restaurierung nicht mehr erhaltener Teile des Schlosses, einschließlich des nördlichen Gartens mit einem Gartenpavillon. Die Forschung vor dem Wiederaufbau brachte einige interessante und bisher unbekannte Erkenntnisse über die Geschichte des Schlosses und der älteren Siedlung.