Die Familie blieb jedoch wütend. Sie hatten Angst vor Scham. Ihr Vater wollte sie vertreiben. Clara ging jedoch in die Kirche, umarmte den Altar und rief: „Du weißt, ich will keinen anderen Bräutigam als Jesus. Ich habe ihn gewählt und werde ihn nicht verlassen.“ Obwohl die Verwandten wütend waren, trauten sie sich nicht, sich ihr zu nähern. Franz führte sie dann zum Kloster St. Angela in Panza, wo sie auch Benediktinerinnen waren. Keine zwei Wochen später gab ihre jüngere Schwester Agnesa bekannt, dass sie ins Kloster gehen wolle. Meine Eltern wollten es schließlich nicht zugeben. Die Legende besagt, dass sie, als zwölf Männer kamen, um sie aus dem Kloster zu holen, so aufgebracht war, dass sie sie nicht bewegen konnten. Als sein Onkel sie schlagen wollte, maß seine Hand. Klára ging dann selbst zu ihren Eltern, um sie zu beruhigen. So widmete sich auch Agnes Gott. Der Bischof von Assisi hat das Haus von Franziskus bei der Kirche St. Damian. Dort platzierte František Klára und die anderen Mädchen, die inzwischen zu ihr gekommen waren. 1215 wählten sie Klára zu ihrer Vorgesetzten, obwohl sie sich widersetzte. Sie lebten ein Leben in Armut, streng nach den Regeln. In den ersten Jahren wurden sie als „arme Geliebte, eingesperrt in St. Damian „oder“ aus dem Community Valley „oder“ Damian“. Erst nach Klaras Tod wurden die Klarissen gerufen.
Obwohl die ersten Regeln auf Wunsch von Klára František verfasst wurden, überarbeitete sie sie später mit Kardinal Hugolín, dem späteren Papst Gregor IX. Diese zweiten Regeln wurden von Papst Innozenz IV. genehmigt, obwohl sie zu streng betrachtet wurden. Von Gregor IX. tatsächlich war ihm zuvor das "Privileg der Armut" zugestanden worden, dh das Recht, nicht an materielle Güter gebunden zu sein. Neben Armut strebte sie auch in anderen Gesellschaften nach Perfektion. Sie erfand verschiedene Tötungsmethoden - sie hatte Dornen in ihrer Tunika, sie wurde mit einer Peitsche mit Knoten am Ende ausgepeitscht, sie trug keine Schuhe, sie aß nur dreimal die Woche durch Fasten, sogar Brot und Wasser. Sie schlief lange auf dem nackten Boden, mit einem Stück Holz anstelle eines Kissens. Den größten Teil der Nacht verbrachte sie im Gebet. Obwohl sie die Oberin war, tat sie die letzte Arbeit: Sie weckte die Schwestern, läutete die Glocken, zündete die Lampen an, fegte das Kloster und wusch den Schwestern die Füße, wenn sie aus der Stadt zurückkamen.
Als sie eine Anführerin wurde, wurde sie sehr unsicher. Deshalb versprach sie Franziskus, dem Kardinal und Bischof von Assisi, Gehorsam. Sie lebte in völliger Armut, ohne Land, ohne festes Einkommen, in einem Gehege. Sie zeigte eine besondere Liebe für den gekreuzigten Jesus. Sie dachte Tag und Nacht über die Schmerzen des Erretters nach. In ihren Krankheiten war sie geduldig und hat gerne mit Christus gelitten. Neben ihrer Krankheit machte sie zumindest Handarbeit, um nicht untätig zu sein. Sie soll mit der Kraft des Kreuzes Teufel ausgetrieben und Kranke geheilt haben.