1647 - 1848
Po získání privilegií svobodného královského města byl Svätý Jur právní na úrovni takových míst jako Bratislava, Trnava, či Košice. Disponoval úplnou samosprávou v oblasti veřejné, soudní a hospodářské. Nadřízenou a tedy i odvolací instancí byl panovník.
Samosprávu reprezentovala 12-členná městská rada, které předsedal rychtář. Rada řešila všechny záležitosti města a byla i soudním fórem. Jejím členem byl i purkmistr, pověřený řízením hospodářství, městský kapitán, který měl na starosti vojenské a policejní záležitosti a městský notář, který vyřizoval písemnou agendu a spravoval městský archiv. Vedle městské radě účinkovala i tzv. vnější rada, která pod vedením tribuna lidu rozhodovala jen v nejdůležitějších otázkách a reprezentovala zájmy celého měšťanstva. Všechny funkce (kromě notáře) byly voleny. Volby se konaly každý rok 24. dubna, hlasovat však mohli jen plnoprávní měšťané. Do aparátu města patřily i další úředníci - městský právník, sirotčí otec, výběrčí daní, komorník, tržní rychtář, hospodář, písař, strážníci a další.
Dohled nad vinohrady, hlídání, dozor nad dělníky, dělbu vinic, jejich oceňování měl na starosti viniční mistr (Perego), 4-6 Hajnice. Tento úřad se v samostatný orgán nevyvinul, jeho práci usměrňoval podle pokynů městské rady purkmistr. K velkým změnám v samosprávě města v letech 1647-1848 / 49 nedošlo, přestože se panovníci snažili zasahovat i do této oblasti městského života.